榮聯科技集團冷凍電鏡數據分析平臺加速科研創新
“冷凍電鏡”全稱冷凍電子顯微鏡技術(Cryo-Electron Microscopy),是指將生物大分子樣品快速冷凍后,在低溫環境下利用透射電子顯微鏡對樣品進行成像,再經圖像處理和重構計算獲得樣品三維結構的方法。冷凍電鏡技術的出現,不僅解決了生物分子結構解析中的諸多難題,也改變了生物領域的研究方式,在細胞生物學、醫學、遺傳學等領域具有廣闊應用前景。
當下,業界主要使用的冷凍電子顯微學結構解析方法包括電子晶體學、單顆粒重構、電子斷層三種,不同方式下的數據產量、分析方法和使用軟件各不相同。通用的冷凍電鏡數據分析平臺多是硬件的堆砌,在通用硬件、存儲系統上部署操作系統、調度系統和應用軟件,通用方案缺乏對業務系統的整體理解。在此背景下,榮聯科技集團冷凍電鏡數據分析平臺應運而生。
榮聯科技集團冷凍電鏡數據分析平臺的設計著眼于各種規模的冷凍電鏡設施,重點針對多用戶場景下冷凍電鏡數據計算中的痛點問題,為用戶提供全套的冷凍電鏡數據分析計算、存儲解決方案。該平臺可以直接接入和控制冷凍電鏡光學系統,實現從數據采集到二維和三維生物結構的分析,并支持全自動化的數據分析流程和實時數據質量信息反饋,具有完備的、可視化的數據管理以及計算歷史追蹤和統計分析功能。用戶通過冷凍電鏡和數據分析系統即可具備完全的冷凍電鏡結構分析能力。
冷凍電鏡數據分析系統基礎架構
冷凍電鏡數據分析系統包含基礎資源層、系統層、應用層(即軟件層)和用戶層四個層次?;A資源層針對冷凍電鏡數據的特點,提供最優化的計算、存儲、網絡架構設計;系統層實現數據管理、自動化流程管理和作業調度;應用層以冷凍電鏡應用軟件為核心,進行數據的分析和處理;用戶層提供強大的用戶監控和遠程操控能力。
除此之外,冷凍電鏡數據分析平臺具備精準匹配、收集自動化、分析模塊化、操作可視化和易維護、可拓展的特性,為了方便數據收集和數據解析,平臺引入自動化收集系統、智能化解析系統,實現開機即用,無需重復性的軟件編譯,使科研工作者將大量精力集中在科學研究中,大幅提升科研效率。
目前,榮聯科技集團冷凍電鏡數據分析平臺解決方案主要應用于生命科學蛋白質結構解析工作線中,已成功服務于西湖大學、清華大學、中科院上海有機所、水木未來等重點行業客戶,積累了豐富的行業實踐經驗。
榮聯科技集團作為國內領先的企業數字化服務提供商,在生物醫療行業深耕十余年,全面布局生物醫療信息服務領域。目前已形成精準診斷平臺、生信分析一體機、冷凍電鏡數據分析平臺等多項特色解決方案,面向臨床醫院、科研機構、測序企業和高等院校提供專業化產品及服務,持續賦能生物醫療行業創新發展。