日韩一区二区久久久_国产麻豆网_播放欧美一级片_亚洲国产日韩一区三区_91日本视频_91网站网址

　　染色質(zhì)重塑是基因表達(dá)動(dòng)態(tài)調(diào)控的重要機(jī)制之一，主要由不同的蛋白質(zhì)/蛋白質(zhì)復(fù)合物完成。SWI/SNF復(fù)合物是其中之一，轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子將SWI/SNF復(fù)合物募集到DNA區(qū)域，沿DNA移動(dòng)并通過(guò)變構(gòu)核小體修改DNA的可訪問(wèn)性或可及性（重塑染色質(zhì)），通過(guò)轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子與暴露的DNA的結(jié)合實(shí)現(xiàn)基因表達(dá)調(diào)控（抑制或者激活）。SWI/SNF亞基基因在20%以上的惡性腫瘤中發(fā)生突變，其亞基的突變會(huì)給癌癥帶來(lái)脆弱性，為新藥研發(fā)提供方向[1]。

　　什么是SWI/SNF復(fù)合物？

　　DNA 包裹在組蛋白周圍形成核小體，這些核小體又盤繞成致密的染色質(zhì)（圖1灰色）。染色質(zhì)處于緊縮狀態(tài)下無(wú)法讀取DNA信息。因此，一種精細(xì)的細(xì)胞機(jī)制與轉(zhuǎn)錄因子協(xié)同工作以動(dòng)員核小體從而控制基因表達(dá)，這一過(guò)程稱為染色質(zhì)重塑。染色質(zhì)重塑復(fù)合物SWI/SNF也稱為 BRG1/BRM (BAF) 復(fù)合物（圖1藍(lán)色）通過(guò)水解ATP獲得能量移動(dòng)核小體并去除組蛋白核心解開DNA，開放狀態(tài)下DNA能被轉(zhuǎn)錄。SWI/SNF復(fù)合物不僅與啟動(dòng)子結(jié)合，還與其他調(diào)控區(qū)域（如增強(qiáng)子和DNA復(fù)制起始區(qū)）緊密結(jié)合。此外，SWI/SNF可結(jié)合/共沉淀許多蛋白質(zhì)，在細(xì)胞周期等過(guò)程中發(fā)揮作用。這表明SWI/SNF復(fù)合物的功能比單純的轉(zhuǎn)錄調(diào)控更為廣泛[2]。

　　SWI/SNF復(fù)合物亞基組成

　　SWI/SNF 復(fù)合物是復(fù)雜的大分子組裝體，由許多不同和可變的亞基組成。SWI/SNF復(fù)合物分成典型BAF復(fù)合物(cBAF)、多溴相關(guān)BAF復(fù)合物（pBAF）、一種新發(fā)現(xiàn)的復(fù)合物（ncBAF）三個(gè)大類，每一類具有不同的亞單位結(jié)構(gòu)和功能，三種類型的BAF都包含核心亞基SMARCC1、SMARCC2和ATP酶（SMARCA4或SMARCA2），協(xié)同調(diào)節(jié)染色質(zhì)的狀態(tài)。此外三種類型既有共享亞基也包括特異性亞基，其中ncBAF包含特異性亞基（GLTSCR1 / 1L和BRD9）[3]。SWI/SNF 復(fù)合物中任何一個(gè)亞基的缺陷都可能會(huì)產(chǎn)生嚴(yán)重后果。在本文中我們將重點(diǎn)關(guān)注 SWI/SNF復(fù)合物亞基突變致癌的作用。

　　SWI/SNF復(fù)合物亞基突變與腫瘤

　　癌癥基因測(cè)序揭示，大約25%的癌癥存在一個(gè)或多個(gè) SWI/SNF亞基基因異常，總共至少有九種不同的SWI/SNF亞基被鑒定為在各種癌癥中反復(fù)發(fā)生突變。那SWI/SNF復(fù)合物亞基突變導(dǎo)致癌癥發(fā)展的機(jī)制是什么？影響 SWI/SNF 亞基功能的突變是否會(huì)給這些癌癥帶來(lái)脆弱性？接下來(lái)將列舉幾種主要的亞基突變與癌癥發(fā)生機(jī)制，以及相應(yīng)的抗腫瘤治療策略。

　　靶向SWI/SNF復(fù)合物ARID1A和 ARID1B

　　目前研究發(fā)現(xiàn)編碼 SWI/SNF 亞基的基因的突變通常會(huì)對(duì)編碼其他 SWI/SNF 亞基的基因產(chǎn)生特定的依賴性，亞基突變不會(huì)完全喪失SWI/SNF 功能，而是依賴于SWI/SNF 復(fù)合物同源亞基的活性導(dǎo)致異常細(xì)胞功能。ARID1A 突變細(xì)胞系特別依賴于其旁系同源物ARID1B，這是最早闡明旁系同源物依賴性的研究之一。ARID1A被發(fā)現(xiàn)在近 50% 的卵巢透明細(xì)胞癌 (OCCC) 和卵巢子宮內(nèi)膜樣癌 (OEC) 中發(fā)生突變。SWI/SNF 復(fù)合物中的 ARID1B是ARID1A 互斥同源物，在腫瘤中ARID1A的突變導(dǎo)致SWI/SNF 復(fù)合物產(chǎn)生了對(duì) ARID1B 的依賴，研究發(fā)現(xiàn)在ARID1A突變細(xì)胞中抑制ARID1B 會(huì)使 SWI/SNF 復(fù)合物不穩(wěn)定并影響細(xì)胞增殖[3]。

　　SMARCA4和SMARCA2同樣，已顯示SMARCA4突變細(xì)胞系對(duì)其旁系同源物SMARCA2的依賴性。SMARCA2和SMARCA4為SWI/SNF的ATP水解酶，負(fù)責(zé)染色質(zhì)的重塑和修復(fù)，SMARCA4是繼ARID1A之后惡性腫瘤中第二頻繁突變的SWI/SNF基因，其作用比SMARCA2更重要。SMARCA4在很多缺乏可靶向癌基因的癌癥中突變，包括10-20%的非小細(xì)胞肺癌、100%的小細(xì)胞卵巢癌、28%的皮膚癌、16%的膠質(zhì)瘤，以及14%的結(jié)腸癌。SMARCA4突變癌細(xì)胞更依賴SMARCA2，因此選擇性SMARCA2抑制劑或降解劑可以誘導(dǎo)SMARCA4缺陷型癌細(xì)胞死亡。這些發(fā)現(xiàn)表明了一種機(jī)制，即 SWI/SNF 亞基的丟失由旁系同源物部分補(bǔ)償，使旁系同源物具有一種特殊的脆弱性[2]。

　　SMARCB1和BRD9這種復(fù)雜的內(nèi)部依賴性不限于旁系同源亞基，目前已顯示SMARCB1突變細(xì)胞系對(duì)非旁系 SWI/SNF 亞基 BRD9的依賴性增加。滑膜肉瘤 (SS) 是一種罕見的間葉來(lái)源惡性腫瘤，約占所有軟組織肉瘤 (STS) 的8%至10%，SS幾乎可以發(fā)生在任何部位，SS具有高轉(zhuǎn)移性。融合蛋白SS18-SSX在100%的滑膜肉瘤病例中發(fā)現(xiàn)，SS18-SSX融合蛋白取代SWI/SNF中正常的SS18亞基。可能由于融合蛋白體積較大，SMARCB1亞基從滑膜肉瘤SWI/SNF復(fù)合物中被置換，SMARCB1被排出及降解導(dǎo)致功能喪失。由于破壞兩個(gè)含有 SMARCB1 的亞基的SWI/SNF 復(fù)合物類型（cBAF 和 pBAF），進(jìn)而增加對(duì)第三個(gè)亞家族（ncBAF）的依賴。研究發(fā)現(xiàn)ncBAF的特異性BRD9亞基的化學(xué)和生物消耗迅速減弱SS細(xì)胞增殖，這些發(fā)現(xiàn)揭示了 ncBAF 復(fù)合物獨(dú)特的染色質(zhì)靶向和功能，并提出了新的癌癥特異性治療靶點(diǎn)。

　　圖5.SS18-SSX融合蛋白替換SMARCB1示意圖（圖片來(lái)源C4 Therapeutics官網(wǎng)）靶向非SWI/SNF 復(fù)合物SMARCB1和EZH2研究表明 SWI/SNF 復(fù)合物和與其他染色質(zhì)修飾物家族Polycomb 阻遏物復(fù)合物(PRCs)具有相反的基因調(diào)節(jié)功能。在正常細(xì)胞內(nèi)，PRC2通過(guò)其酶亞基(EZH2) 催化維持H3K27三甲基化 (H3K27me3) 標(biāo)記，促進(jìn)染色質(zhì)凝集，從而抑制轉(zhuǎn)錄。SWI/SNF 復(fù)合物定位于H3K27ac位點(diǎn)，與轉(zhuǎn)錄因子合作建立開放的染色質(zhì)狀態(tài)，促進(jìn)轉(zhuǎn)錄。SWI/SNF復(fù)合物對(duì)PRC2（含有EHZ2亞基）起到抑制作用，促進(jìn)PRC2的靶基因的表達(dá)，促進(jìn)轉(zhuǎn)錄的進(jìn)行[2]。

　　復(fù)合物與PCR2定位[2]SMARCB1（INI1）的缺失在90%以上的上皮樣肉瘤（ES）病人中發(fā)生，且成為ES的一個(gè)典型的診斷特點(diǎn)。在ES中SMARCB1發(fā)生突變或缺失時(shí)導(dǎo)致EZH2活性增強(qiáng)，H3K27me3水平升高，造成組蛋白和DNA緊密結(jié)合，很多抑癌基因的表達(dá)受到抑制，而hedgehog、MYC等信號(hào)通路基因等上調(diào)，促使細(xì)胞增殖，形成腫瘤。研究發(fā)現(xiàn)在ES中，使用EZH2抑制劑特異性作用于靶點(diǎn)EZH2時(shí)，降低EZH2活性，最終染色質(zhì)的“捆綁和束縛”得到釋放，基因得以正常表達(dá)，達(dá)到殺死腫瘤的效果。EZH2抑制劑Tazemetostat在2020年1月獲得FDA批準(zhǔn)，用于治療16歲及以上、不符合完全切除條件的轉(zhuǎn)移性或局部晚期ES兒童和成人患者。

　　ARID1A與ATR研究發(fā)現(xiàn)SWI/SNF 復(fù)合物還與 DNA 損傷修復(fù) (DDR)的幾種機(jī)制有關(guān)。不同的 SWI/SNF 家族成員已被證明在 DDR 中具有不同的作用，從重塑DNA 損傷位點(diǎn)周圍的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)到直接招募 DDR所需的蛋白質(zhì)。cBAF和pBAF復(fù)合物涉及非同源末端連接 (NHEJ) 和同源重組 (HR)修復(fù)過(guò)程。ARID1A 通過(guò)與 ATR 的相互作用被招募到DNA雙鏈斷裂（DSB）處，為了應(yīng)對(duì) DNA 損傷，ARID1A 促進(jìn) DNA DSB 末端加工以生成 RPA 包被的單鏈 DNA (ssDNA)，并維持 ATR 激活以響應(yīng) DSB。ARID1A 的缺失導(dǎo)致檢查點(diǎn)激活和DSB 修復(fù)受損，這使細(xì)胞對(duì) DSB 誘導(dǎo)治療敏感，例如PARP抑制劑，ATR抑制劑[6]。臨床前數(shù)據(jù)證明了 ARID1A 缺失與 VX-970（ATR 的抑制劑）之間的協(xié)同作用，以及 PARP 抑制劑與放射治療在 ARID1A 突變腫瘤中的功效。PARP 或 ATR 抑制劑目前正在幾項(xiàng)ARID1A 突變癌癥患者的試驗(yàn)中被評(píng)估[2]。

　　2022AACR公布的SWI/SNF復(fù)合物亞基突變治療新策略

　　BRD9靶向抑制劑

　　CFT8634根據(jù)上文的機(jī)制在滑膜肉瘤病例發(fā)現(xiàn)100%SS18-SSX融合蛋白，針對(duì)SS18-SSX融合蛋白本身很難開發(fā)藥物，根據(jù)SS18-SSX融合導(dǎo)致SMARCB1脫離cBAF、pBAF復(fù)合物，使得染色質(zhì)重塑復(fù)合物更依賴ncBAF, 那么靶向ncBAF復(fù)合物的特異性亞基BRD9就有可能抑制SMARCB1缺失腫瘤[5]。C4 Therapeutics公司的CFT8634是一款雙特異性分子，它能夠?qū)RD9和E3泛素連接酶CRBN連接在一起，在BRD9蛋白上添加泛素修飾，導(dǎo)致BRD9的特異性降解。傳統(tǒng)的小分子抑制劑僅僅限制了乙酰賴氨酸溴化酶的閱讀功能，而降解技術(shù)能夠最大化破壞ncBAF復(fù)合物的致癌活性。在滑膜肉瘤的臨床前模型中，CFT8634表現(xiàn)出持續(xù)降低腫瘤體積的效果。這款在研療法已經(jīng)獲得美國(guó)FDA授予治療滑膜肉瘤的孤兒藥資格，其IND申請(qǐng)?jiān)诮衲?月底獲得許可，預(yù)計(jì)在今年上半年開始針對(duì)滑膜肉瘤患者的I期臨床試驗(yàn)。

　　圖7.CFT8634臨床前腫瘤抑制效果（圖片來(lái)源：C4 Therapeutics官網(wǎng)）Foghorn公司研發(fā)的FHD-609也是BRD9的選擇性蛋白質(zhì)降解劑，在臨床前研究中，F(xiàn)HD-609已被證明可以選擇性地降解BRD9，利用與SS18-SSX易位的合成致死關(guān)系殺死癌細(xì)胞，目前FHD-609是第一個(gè)進(jìn)入臨床的BRD9降解劑。

　　SMARCA2選擇性抑制劑PRT3789SMARCA2和SMARCA4 都是SWI/SNF復(fù)合物的ATP酶，負(fù)責(zé)染色質(zhì)的重塑和修復(fù)。SMARCA4突變癌細(xì)胞依賴旁系SMARCA2，因此選擇性SMARCA2抑制劑或降解劑可以誘導(dǎo)SMARCA4缺陷型癌細(xì)胞死亡。在SMARCA4突變肺癌細(xì)胞系中的全基因組CRISPR篩選表明，MCL1的丟失可以使SMARCA4突變肺癌細(xì)胞對(duì)SMARCA2降解敏感，Prelude Therapeutics公司的SMARCA2降解劑 PRT3789 聯(lián)用MCL1抑制劑PRT1419在SMARCA4突變肺癌模型中產(chǎn)生協(xié)同作用，并且不影響SMARCA4野生型細(xì)胞。PRT3789對(duì)SMARCA2選擇性強(qiáng)（超SMARCA4 20倍），體內(nèi)外模型耐受良好，Prelude預(yù)計(jì)2022年年底申報(bào)臨床。

　　SMARCA2/SMARCA4雙抑制劑FHD-286Foghorn今年AACR披露首個(gè)進(jìn)入臨床的SMARCA2/SMARCA4雙抑制劑 FHD-286臨床前數(shù)據(jù)。FHD-286是Foghorn公司一款BAF復(fù)合物口服抑制劑，用于治療AML和葡萄膜黑色素瘤（UM）。FHD-286通過(guò)抑制BAF復(fù)合體中的ATP酶成分SMARCA4和SMARCA2，抑制BAF的功能。FHD-286抑制SMARCA2/SMARCA4影響SPI1轉(zhuǎn)錄水平及其下游轉(zhuǎn)錄程序，從而影響細(xì)胞增殖和細(xì)胞存活。SPI1是一種 ETS 家族轉(zhuǎn)錄因子，在造血發(fā)育和分化中起關(guān)鍵作用，SPI1表達(dá)調(diào)節(jié)與急性髓性白血病 (AML) 的腫瘤發(fā)生有關(guān)。臨床前證據(jù)顯示FHD-286在AML患者樣品中廣泛有效，低納摩爾劑量具有促進(jìn)細(xì)胞分化的作用，細(xì)胞殺傷作用與標(biāo)準(zhǔn)療法相當(dāng)，劑量依賴性抑制腫瘤生長(zhǎng)(圖8)。目前FHD-286已開展針對(duì)AML/MDS的I期臨床試驗(yàn)。

　　在85%葡萄膜黑色素瘤（UM）中存在GNAQ / GNA11突變，其轉(zhuǎn)錄因子MITF和SOX10過(guò)表達(dá)并與BAF復(fù)合物過(guò)度相互作用，F(xiàn)HD-286抑制SMARCA2/SMARCA4，導(dǎo)致SOX10 和 MITF 轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)的可及性喪失，抑制依賴SOX10和MITF的基因（GNAQ / GNA11）表達(dá)，臨床前數(shù)據(jù)顯示FHD-286劑量依賴性抑制腫瘤生長(zhǎng)（圖9）。目前FHD-286已開展針對(duì)UM的I期臨床試驗(yàn)。

　　AU-15330SWI/SNF復(fù)合物的組分在一些癌癥中發(fā)生了突變，但在前列腺癌中很少發(fā)生。相比于SWI/SNF復(fù)合物的亞基發(fā)生突變的癌癥，由雄激素受體（AR）或FOXA1驅(qū)動(dòng)的前列腺癌對(duì)SWI/SNF降解劑更敏感。AU-15330是Aurigene 公司的一款SWI/SNF ATP酶亞基（SMARCA2和SMARCA4）的蛋白水解靶向嵌合體降解劑。主要的作用機(jī)制是降解SMARCA2和SMARCA4，阻止對(duì)染色質(zhì)的訪問(wèn)，壓縮AR、FOXA1、ERG 和 MYC 的核心增強(qiáng)子周圍的染色質(zhì)，轉(zhuǎn)錄因子被阻止與驅(qū)動(dòng)癌癥的增強(qiáng)子結(jié)合，從而減弱促癌轉(zhuǎn)錄程序[9]。AU-15330 在前列腺癌異種移植模型中可有效抑制腫瘤生長(zhǎng)，并與 AR 拮抗劑 enzalutamide 協(xié)同作用（圖10）。